超14万种肠道病毒“出土”，全人类肠道病毒的作用是什么？

Science daily

虽然排泄透海洋生物集合近年来成为了研究工作热点，但是我们对它们的理解一直有很多空白的地方，比如涉及到排泄病原体，我们理解的就更加少了。

病原体是大概数量多于的海洋生物并不一定，在生命体排泄环境里也不例外。2月18日，Wellcome Sanger和EMBL-EBI研究工作所的研究工作管理人员在《细胞》（Cell）上释出的一项重磅研究工作，挖掘出了贫困在生命体排泄里的14万余种病原体，其里一半以上的病原体以前从未见过。这个挖掘出为研究者排泄病原体与芽孢的数间的关系以及它们如何冲击生命体身体健康开辟了属于自己研究工作唯一可。

DOI：https ：//doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.029

人体排泄里发挥功用的大多数病原体是核酸。研究工作管理人员使用宏基因小组学方法，对28060个公共生关系命体排泄元基因小组和从生命体排泄人才培养的2898个芽孢复合基因小组里挖掘出的病原体物种的海洋生物自然环境透过界定，获取了生命体排泄核酸自然环境的全面视图。

迄今最零碎的生命体排泄核酸氨基酸数据库

这一构想相关联了排泄核酸的芽孢芽孢分配和芽孢范围、生命体贫困方式与核酸类型的全球排泄常见于等内容。同时，研究工作管理人员挖掘出了一个属于自己倾斜度普及的分支，即一小组被并不认为有共同完成祖先的病原体，并将其命名为Gubaphage。这是迄今挖掘出的生命体排泄里第二大普及的病原体分支，中排2014年挖掘出的crAssphage。

Gubaphage是排泄里十分大多的变异叶

核酸变异叶的挖掘出是生命体排泄里倾斜度普及核酸的又一典型例子，对其进一步人才培养和透过的系统研究工作，可以努力我们更加好地理解其在生命体排泄霉菌集合里的功用。

同时，这个研究工作再次告诉我们，并非所有的病原体都是有害的，有时它们亦然了排泄生态系不可或缺的小当今世界。因为研究工作里的取样主要来自身体健康群体，他们没有任何类似的传染病。同时，挖掘出的大多数病原体都以DNA作为遗传物质，这与大多数人所熟知的病原体不同，如SARS-CoV-2或寨卡病原体等，它们是RNA病原体。因此可以称许，生命体排泄病原体基因小组有着稳定、多样、倾斜度群体化的特点。

该研究工作的高级核酸研究工作正在漫长一场复兴。这个高品质、大规模的生命体排泄病原体录入不算正是时候，可以作为指导期望病原体体研究工作的生物科学和变异分析的构想。”

生命体排泄是一个令人难以置信的海洋生物自然环境环境。众所周知，我们排泄透海洋生物小组的失衡就会随之而来传染病和复杂的状况，如高血压肠病、过敏症和肥胖症。但对于我们的排泄芽孢以及病毒它们的病原体（核酸）在生命体身体健康和传染病里所充当的女角，人们理解得一般来说较少。部份原因是由于使用当前的宏基因小组学和海洋数据处理方案和新技术分析发挥功用相比较。在此之后，生命体排泄病原体被叫作“病原体暗物质”，因为其界定发挥功用倾斜度群体差异，病原体数据库大多不零碎。

随着更加多研究工作的消失，生命体排泄病原体多种集合落已被并不认为与身体健康有关，除此以外在患病和闭环免疫系统里起功用，例如在HIV患者的更加为严重性传染病和高血压肠病（IBD）等传染病。研究者并不认为，生命体排泄病原体主要通过忽略芽孢自然环境和推动新技术水平基因转移在塑造排泄生态系里起着最重要功用。

2019年，来自美国哈佛医学院的研究工作管理人员用一小组确切的生命体排泄共生关系霉菌对人体内透过定殖后，并通过共同点裂解核酸捕食。研究工作显示，核酸捕食不仅正因如此易感霉菌，而且通过芽孢数间的相互功用随之而来对其他芽孢种类的连带冲击。这些人体内的粪便人体内小组学揭示了人体内排泄透海洋生物集合里的核酸捕食可以通过忽略参与小肠流动性和盲肠收缩等最重要系统的更为最重要人体内物的新技术水平来潜在地冲击哺乳昆虫芽孢。

核酸在人体内模型里对排泄霉菌集合和人体内小组的动态闭环。Cell Host & Microbe，DOI：https ：//doi.org/10.1016/j.chom.2019.05.001

当排泄病原体集合落失衡时，意味著反之亦然传染病的消失。也有令人信服的结论指出核酸参与了几种传染病。例如，在一项关于IBD患者霉菌集合界定珍贵度的研究工作挖掘出，与身体健康对照小组比起，IBD患者粪便取样里的Faecalibacterium prausnitzii（一种通常在IBD群体里过剩的芽孢）的原核酸更加大多或更加珍贵，这指出这些核酸意味著在传染病病理生理学里持久。IBD与病原体小组之数间的这种数间的关系也不仅限于生命体研究工作。曾有昆虫实验者显示，在人体内大肠里，排泄核酸集合落引发了多种不同生命体IBD患者里判读到的混合物转变，挖掘出大肠昆虫的核酸集合落自然环境增高，核酸可数拓展。

关于各种传染病正常下生命体排泄病原体体变化的部份研究工作。Studying the gut virome in the metagenomic era: challenges and perspectives.

病原体是排泄稳态和炎症的最重要后座。在这方面，关于病原体体只能诱导过后的低新技术水平免疫系统，而不引起任何明显的症状的能力早已被记录在案，适用于一些近期病原体，除此以外疱疹病原体和多瘤病原体，以及一些群体里的乙肝（HBV）和丙肝（HCV）病原体。有结论指出，核酸也意味著与生命体癌细胞直接相互功用。例如，口服给药的核酸在体内举例来说到系统小组织里，在那里诱发先天性和适应性免疫系统。

然而，人们对核酸引起先天性抗病原体免疫系统的的系统大相径庭。核酸与癌细胞相互功用的意味著的系统是通过它们与芽孢透海洋生物小组的关联。一些芽孢核酸将共生关系霉菌作为自身基因小组的载体，在特定条件下，如性传染病等意味著，诱导核酸颗粒的表达，可被癌细胞检测到。其他核酸通过产生只能修饰沙门氏霉菌、大肠杆霉菌、志贺氏霉菌和霍乱弧霉菌等透海洋生物里脂多糖（LPS）的O-抗原混合物的酶来闭环芽孢的抗原性。

因此，所需注意的是，尽管许多传染病显示与各种核酸有关，但要确切因果数间的关系却极其艰难。此外，在这些关联研究工作里，很难确切透海洋生物小组和病原体体的忽略是传染病的原因还是结果。

迄今，世界各地的研究工作管理人员正着手研究工作生命体排泄透海洋生物小组里的古霉菌、真霉菌、跳蚤，以及病原体和芽孢。生命体排泄核酸自然环境构想的消失，无疑对研究工作生命体排泄里的透海洋生物集合落如何冲击生命体身体健康和传染病更为有用。而就在2020年7月，EMBL–EBI的研究工作管理人员在《自然海洋生物新技术》（nature biotechnology）上同样释出了一份无与伦比的生命体排泄生态系清单，从生命体排泄里的4600多种芽孢里。期望我们所需做的，就是把两份构想联系起来，揭开排泄病原体、芽孢数间的联系。

来自生命体排泄透海洋生物小组的204938个参考基因小组的为统一录入。A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.

总之，排泄透海洋生物小组构想的绘制是该研究工作科技领域的最重要典范事件，将成为研究者开始研究工作并努力理解每个透海洋生物种在生命体排泄生态系里功用的宝贵资源。努力我们能在期望阐明病原体、芽孢等透海洋生物集合与芽孢身体健康和传染病之数间确切数间的关系。